MIMIC数据集患者时间戳的GAP现象_数据_现象
with icustays_ts1 as ( select i.stay_id, i.subject_id, i.hadm_id, i.intime, i.outtime, a.admittime, a.deathtime, a.dischtime from icustays i left join mimiciv_hosp.admissions a using (hadm_id))select from icustays_ts1 where -- 涌现去世亡,但出ICU韶光大于即是出院韶光(不可能涌现大于的征象) outtime <= deathtime and outtime >= dischtime
上述代码的运行结果如下图(单击以放大局部):我们创造下列患者发生去世亡结局事宜,且患者去世亡的韶光晚于出ICU的韶光(可能转出后去世于其他科室,即发生院内去世亡事宜),但患者的出ICU韶光却大于出院韶光。理论上讲患者如果发生院内去世亡结局事宜,那么即可认为其出院,以此便于打算院内的勾留韶光。
此外,由于MIMIC-IV 2.0以上版本的数据集包含马萨诸塞州CDC的院外去世亡数据(即patients表的dod字段,该死亡数据来自两个来源: 院内HIS系统和马萨诸塞州生命记录统计登记处,其数据分辨率为日期)。由于该院外去世亡数据的存在,可能和患者几个韶光戳产生其他GAP的各类情形(去世亡日期早于出院韶光......)。此处不再进行展示。二、easyBDCC学习群内关于GAP征象的谈论如第一部分的内容所示,MIMIC数据集的GAP征象紧张是由于各个韶光戳的重叠或滞后,不符合真实天下的逻辑。部分学员在探索数据集以及书写项目时也创造了GAP的征象,下列群内的谈天记录是关于GAP征象的谈论和解释,欢迎大家进行谈论。
经由上述阐明后,相信有过ICU从业经历的老师能很快理解我们讲述的内容,由于这在海内ICU也同样常见(环球ICU一盘棋,大家碰着情形都相类似)。基于上述谈论内容紧张GAP缘故原由总结如下:
① 患者先行进入的ICU治疗,产生了实际的韶光戳,但是由于未能及时办理入院,导致的入院韶光晚于入ICU韶光;
② 患者发生ICU去世亡事宜或转出ICU后发生院内去世亡事宜,但未能及时办理结算,或者办理结算后未能及时联系太平间进行转移,导致出ICU韶光远远晚于ICU去世亡韶光或出院韶光,涌现较大的GAP;
③ 患者涌现非医嘱离院(自动出院)后,回到养老机构或家里之后,由于短缺相应的器官功能支持治疗迅速发生去世亡(going home to die, GHTD),由于州立CDC去世亡数据的分辨率这天期(0时0分0秒),导致出ICU日期或出院日期和院外去世亡数据存在“反向”GAP;
④ 更多逻辑GAP缺点不再逐一列出......
三、办理方案BDMCC增强型表单修复上述bug,有效办理关键韶光戳混乱的问题。四、为什么选择easyBDCC (包含课程、BDMCC软件、strong包)easyBDCC课程包含常见的重症大数据挖掘的实战课程。课程将有效的办理各大重症大数据的实战问题。BDMCC软件将支持至少9个重症数据集的一键安装(针对每个数据集陆续会推出BMDCC系列增强表单,有效减少SQL代码量,减少官方数据存在的逻辑Bug)。软件支持Linux、Windows、macOS(支持M系列芯片),支持做事器集群,完玉成平台的覆盖安装。无论利用条记本,亦或是做事器,我们均支持支配运用。在这里您可以体会到项目流程化的数据管理与项目开拓技巧。strong包进行数据剖析会有效减少代码量。部分学员现在利用strong包后在一天内即可完玉成部项目的数据剖析。此外,我们拥有极强的重症数据库开拓支配能力。BDMCC软件、strong包开拓者为海内ICU一线年夜夫,具有丰富的ICU临床履历,同时具有构建跨平台重症EDC的技能能力。下图为我们开拓的跨平台重症EDC系统,从数据采集、数据支配、数据洗濯、数据剖析建模,形成完全的技能闭环,打造国人自己的MIMIC数据集。五、BDMCC即将提价BDMCC V1.0.6版本即将支持INSPIRE数据集,在面向零根本用户的根本课程以及实战三项目课程更新完毕后,easyBDCC课程(课程包含软件BDMCC以及strong包)操持提价至3630元,提价估量在5月尾进行,欲购从速!
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